Fundado em 1994 o Jotinha era chamado de Malutrom, devido a união de duas famílias tradicionais de Curitiba: Malucelli e Trombini. 

Em 2000, o então Malutrom teve reconhecimento nacional ao participar e ser campeão do módulo verde e branco do campeonato brasileiro, principal título até hoje.

  

Em 2009, em uma parceria inédita na história do futebol brasileiro entre Corinthians Paulista e o JMalucelli Futebol, o clube usou o uniforme com as cores alvinegras e o escudo semelhante ao do time paulista e passou a ser chamado de Corinthians Paranaense. A experiência teve duração de três anos, com saldo de um vice-campeonato em 2009 e a revelação do atleta Jucilei, que com passagem pelo time paulista chegou a seleção brasileira e foi vendido para a futebol russo.

Visando o fortalecimento institucional da marca JMalucelli, o clube passou a se chamar JMalucelli Futebol em 2013.